幼年时期
尽管水门夫妇临终前留下遗言，希望木叶村民把鸣人视为村子的英雄，但出于保密，除三代和少部分了解内情的村民外，鸣人的身世并未对外公布，连鸣人本人也不知道。村子里的大部分人都将鸣人视为九尾的化身，纷纷对他冷眼相待，鸣人从小在孤独中成长。他一直想要得到别人认可，因此他经常在村内搞恶作剧，吸引别人注意。他的恶作剧甚至严重到在木叶的火影岩上涂鸦。[14]
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成为下忍前的鸣人
晋升下忍
鸣人与佐助、樱为木叶隐村忍者学校的同期学员。在第三次毕业考试中失败。监考老师水木以让他通过测试为理由，利用鸣人去偷窃禁术卷轴，但阴谋被伙伴伊鲁卡识破，拼死前去解救鸣人。
鸣人学会禁术卷轴中的多重影分身之术击败水木。伊鲁卡老师认可他以此通过考试毕业，鸣人与同届8名毕业生正式成为下忍，三人后被分配到卡卡西所带领的第七班。在进行铃铛演习过程中，他们各自为战，最终落败。之后佐助领悟到老师要他们有团结精神，打破卡卡西的规则喂鸣人吃饭，终于通过了生存测试。
波之国任务
三人正式成为下忍后，一向从事的都是d级任务，如找宠物、清洁河道等，鸣人本身亦有怨言。[15] 终于他们获得护送重要人物的c级任务，其内容就是要安全护送桥梁建筑师达兹纳先生返回波之国。[16]
在卡卡西的带领下，他们陪同达兹纳出发。但途中遇上来自雾隐村的敌人，鸣人因从未有实战经验，心有恐惧，手背中毒；[16] [17] 相反佐助及樱表现镇定。鸣人于是通过划破手背放毒来表明决心。
之后他们遇上更强的敌人——叛忍桃地再不斩。当卡卡西被再不斩以水牢术困住时，鸣人与佐助配合使用佯攻战术吸引再不斩的注意力，解开了对卡卡西的束缚。[18] 卡卡西击败再不斩后，指导鸣人、佐助和樱如何控制查克拉。鸣人和佐助互相竞争，最后均能爬到树顶。[19] 鸣人他们寄宿在波之国伊那利家里；同时他认识了一名神秘少年。
不久，再不斩带着拥有血继限界的少年白再度出现，向第七班复仇。白与佐助交手。此时鸣人打败卡多派来绑架伊那利一家的两名手下后，[20] 匆忙赶到的他却鲁莽地冲进了白的陷阱。佐助唯有利用刚开启的写轮眼应付白的行动，同时掩护受重伤的鸣人。
白利用这一弱点，攻击鸣人使佐助露出破绽。佐助明知是计，却用自己的身体掩护鸣人，身受重伤倒下。鸣人误以为佐助被杀，愤怒之下使出九尾的力量击败白。白的面具脱落，鸣人才知道他原来是先前所认识的那位少年。白承认自己输了，请求鸣人杀掉他；而白感到再不斩处于危险中，向鸣人道歉并离去，并为再不斩挡了卡卡西的致命一击。
当鸣人得知白的死讯后，向看似冷漠的再不斩讲述了白对他的忠诚和情谊，让再不斩这个铁血之人流下了眼泪。
再不斩因此牺牲了自己的性命，反过来把作恶多端的卡多杀死。而佐助不久亦从昏迷状态中苏醒过来。第七班顺利完成任务，准备返回木叶。达兹纳为感谢鸣人相助，把新桥梁命名为“鸣人大桥”。[21]
中忍考试
第七班返回木叶又执行了一些琐碎的任务后，木叶准备举行中忍考试。鸣人、佐助及樱三人最终亦决定参加。
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第七班
第一轮是笔试，鸣人虽然一题也不会做，但还是坚持留了下，通过了考官森乃伊比喜的考验。[22]
第二轮是生存试练，在死亡森林内与其他考生争夺用来晋级的卷轴。第七班途中遇上伪装成草忍考生、已叛离木叶的大蛇丸。佐助对大蛇丸有些害怕，鸣人用激将法使佐助振作起来。但实力悬殊，佐助被大蛇丸在脖子上留下天之咒印，并晕了过去。鸣人亦中大蛇丸的五行封印，九尾查克拉被封印起来而昏迷过去。樱只得自行照顾佐助及鸣人。[23] 三人恢复之后，又继续考试，但时间所剩无几。幸得药师兜前辈指点，击败三名雨忍成功夺取卷轴过关
第三场考试分预赛及淘汰赛。鸣人的预赛对手是犬冢牙和赤丸。牙的秘术一度使鸣人处于下风；但鸣人却用计令牙误伤赤丸，又因突然放了一个屁，严重影响牙的进攻，用自创的体术打败了牙。赛后，鸣人受到“三忍”之一自来也的帮助，解除五行封印，又学会了控制查克拉和通灵之术。
进入淘汰赛，鸣人遇上有“天才”之称的日向宁次，被宁次的攻击封住穴道而使不出任何查克拉，但因赛前得到指点，释放九尾的查克拉击败宁次，获得全场欢呼。
之后砂忍及音忍发动袭击，兜竟也是大蛇丸的部下。佐助急于追赶我爱罗，卡卡西命令鸣人等人务必阻止佐助胡乱行动。我爱罗开始化身守鹤，打倒了佐助与樱。鸣人抛开恐惧与我爱罗交战并将其压制，后来我爱罗进一步化成完全体的“砂之守鹤”，鸣人亦通灵出蛤蟆文太，再组合变身为九尾妖狐，控制住守鹤。鸣人把正沉入睡眠中的我爱罗撞醒，守鹤力量被压制起来。最后鸣人一拳打倒我爱罗。二人双双倒地，鸣人在对话中解开了我爱罗一直以来的心结。樱及佐助获救，我爱罗等人也撤离木叶。[24] 众人回到木叶后，却收到三代在与大蛇丸的对决中牺牲的噩耗。[24]
击败我爱罗
三忍决战
火影位置空缺。自来也带鸣人寻找纲手，并尝试教鸣人“螺旋丸”。纲手原本瞧不起鸣人，对鸣人成为火影的理想感到可笑，后与鸣人约定若鸣人一周内学会螺旋丸，就把项链给他。鸣人为实现约定而努力修炼。[25]
修炼螺旋丸
在三忍决战中，鸣人舍身保护纲手，以螺旋丸重创兜。被感化纲手的终于决定回村担任火影，又按约定送项链给鸣人，把一切希望都托付在鸣人身上。[26]
追捕佐助
听闻鸣人的表现，佐助深感自己力量不足，欲追求更强大的力量，以向哥哥鼬报仇，于是听从了“音忍四人众”的劝诱、投奔大蛇丸。木叶虽收到佐助叛离的情报，但因之前受到袭击，百废待兴，只能派鸣人、鹿丸等人去追捕。临行前，鸣人与樱定下约定——把佐助带回木叶。
第二次终末之谷的决斗
鸣人等人途中先后遇上四人众的阻挠，而伙伴们亦豁出性命让鸣人追上佐助。但又突然出现更强的敌人君麻吕，鸣人试图用影分身之术对付君麻吕，但不起作用；李洛克和我爱罗及时赶到，使自己可以继续追赶佐助。二人最终在终末之谷展开决斗。最终进入二重咒印、使用写轮眼与千鸟的佐助，击倒了使用九尾力量与螺旋丸的鸣人，但未下杀手。[27] 事后鸣人为变强而跟随自来也在外修行。[28]
踏上修行的旅途
营救我爱罗
两年后，鸣人回归木叶，与卡卡西、樱重组第七班。三人收到紧急增援砂隐的任务，与千代婆婆前去营救现任风影我爱罗。中途鸣人一度中了鼬的幻术，幸被千代与樱解除，随后与卡卡西击败了鼬的分身。[29]
我爱罗被抽出尾兽而死。“晓”成员迪达拉用我爱罗的遗体挑衅鸣人。鸣人在卡卡西劝导下勉强保持冷静，并配合卡卡西将迪达拉击落，但在确认我爱罗已死后还是因激动而外漏妖狐外衣。卡卡西急忙用自来也给的符制住鸣人。迪达拉则用自爆分身逃走，卡卡西耗尽体力转移了爆炸。
千代被鸣人所表现的真挚友情感动，于是牺牲自己用转生之术复活了我爱罗。
天地桥之战
木叶高层、“根”首领志村团藏派佐井加入七班，以协助为名执行追杀佐助的任务。
天地桥大战
纲手派大和暂代修养中前辈卡卡西担任七班的新队长，率鸣人、樱、佐井前往天地桥，寻找佐助与大蛇丸的情报。鸣人与樱虽对佐井的假意笑容及毒舌十分反感，但为拯救佐助，即使与不喜欢的人合作也心甘情愿。在天地桥，七班与大蛇丸和兜对峙。鸣人受大蛇丸挑衅，妖狐外衣泄露。大蛇丸与失去自我意识的鸣人展开激战，因身体不能承受而只好撤退；鸣人亦被大和的木遁所压制，变回人形。鸣人为自己误伤了樱而内疚，但同意大和所说，要不断修炼，用自己的力量去保护身边重要的人。
再会佐助
大和查出大蛇丸的巢穴，众人深入虎穴，抓住背叛他们的佐井。佐井问鸣人为何执着于要拯救佐助，鸣人表示自己与佐助之间有着兄弟般的“羁绊”。佐井受鸣人感动，最终决定协助七班拯救佐助。鸣人和樱与佐助再会，但佐助冷漠的态度及强大的实力却出乎意料之外。佐助称要把鸣人杀掉，以斩断彼此间的“羁绊”。大蛇丸及兜再次出现，阻止佐助下杀手，目的是要留下能铲除“晓”的力量。佐助于是随大蛇丸离去。众人拯救佐助的目标再度失败，但却得到了真心的伙伴佐井。[6]
第七班再会
飞段角都之战
鸣人在卡卡西老师与大和队长的帮助下开始修炼查克拉性质变化的修行，为了能够学会风的查克拉性质变化，鸣人使用影分身跑到阿斯玛老师的家里向阿斯玛老师请教风的性质变化的诀窍，阿斯玛从背包里取出两把查克拉刀，向鸣人讲解了这刀是用能吸收持刀人查克拉性质的特殊金属制成的，风的性质变化是把查克拉分成两部分后，再磨合到一起，然后两股查克拉再以磨薄的感觉相互揉捏进去，诀窍就是磨的更薄更锋利的感觉，之后阿斯玛为鸣人展示了查克拉刀的威力，阿斯码将查克拉刀投向一棵树，鸣人惊讶的感叹“不仅将树打穿，连后面坚强的岩石也刺出了痕迹“，阿斯玛告诉鸣人只是向鸣人展示所以自己并未使出全力，如果使用全力的话，那颗石头也会被穿透的，等级相同的忍者再以刀剑死斗的时候，胜负往往取决于刀刃的锋利程度，风的性质变化再终端距离的战斗中是最有攻击力的，风性质的忍者可是很少见的。[30]
阿斯玛在与“晓”的对战中牺牲。卡卡西把修行之事交给大和、而自己负责照顾准备报仇的第十班。卡卡西和第十班在对战“晓”角都时陷入苦战，大和及时带鸣人等人赶到。最终鸣人用新术风遁·螺旋手里剑击败了角都，但右手也因新术威力过大而受创。纲手禁止鸣人再用此术。[31]
追捕宇智波鼬
为得知晓的情报、追寻佐助的下落，木叶派出七班和八班追捕鼬。鸣人的影分身独自遇上鼬。鼬在确认鸣人拯救佐助的决心后，将一只乌鸦送入鸣人体内并离开。
佩恩入侵
鸣人回到木叶，得知自来也被佩恩杀害的噩耗。为此曾一度悲伤的他，在伊鲁卡和鹿丸的鼓励下再度振作。[33]
鸣人前往妙木山修炼“仙术”训练。佩恩六道突袭木叶，得知鸣人不在村中，便用神罗天征摧毁了全村。习得仙人模式和新术仙法·风遁·螺旋手里剑鸣人紧急回到木叶，实力今非昔比，且还有多位蛤蟆的帮助。但佩恩实力也很强。鸣人辛苦打败五个佩恩，但最终被天道佩恩抓获。雏田为救鸣人而出被天道打伤，鸣人误以为雏田死亡，愤怒之下爆出八条尾巴，天道用地爆天星困住鸣人。[34]
鸣人在九尾怂恿下准备揭开封印之时，四代封印的查克拉现身阻止，鸣人才得知自己的身世