哈利和他的朋友们决定展开调查。他们首先想到的是多比，曾经是马尔福家的家养小精灵，现在已经是自由精灵，多比告诉哈利，他感觉到一种古老而强大的黑暗力量正在逐渐苏醒。为了确认这个猜测，哈利决定去访问霍格沃兹历史上最古老的地方之一——禁忌森林深处的古老祭坛。
他们在一个月黑风高的夜晚进入了禁忌森林。在森林深处，他们发现了一座古老的石碑，上面刻满了奇异的符文。赫敏通过研究符文，发现这是一座封印祭坛，封印着一种古老的黑暗力量。这个封印已经开始松动，而一旦完全解除，整个魔法界将陷入无尽的黑暗。
就在这时，一阵冷风吹过，一个阴影从树林中浮现。哈利认出了那是他们多年的宿敌，死而复生的食死徒贝拉特里克斯·莱斯特兰奇。她狞笑着，手中握着一把黑色的魔杖，显然是来解开封印的。
哈利和贝拉特里克斯展开了激烈的战斗。魔咒在空中交织，火光四溅。就在哈利即将击败贝拉特里克斯时，她突然消失在一阵黑雾中，留下了一个诡异的笑声。显然，她已经成功解开了部分封印，黑暗力量正在蠢蠢欲动。
回到霍格沃兹，哈利和他的朋友们召开了一次紧急会议。他们决定必须找到封印的关键，彻底封印住黑暗力量。然而，解开这个谜团的线索被分散在各个古老的魔法书籍和隐秘的地方。于是，他们分头行动，寻找线索。
赫敏和罗恩前往霍格沃兹的图书馆，查阅那些被遗忘的古老卷轴和书籍。哈利则决定去拜访邓布利多的老朋友，传说中的魔法师尼可·勒梅，希望他能提供一些有价值的信息。与此同时，其他凤凰社的成员也开始在魔法界各地搜寻线索。
时间紧迫，黑暗力量的影响逐渐蔓延，整个霍格沃兹学院开始被一种无形的恐惧所笼罩。学生们开始失踪，教室里的黑板上突然出现诡异的文字，甚至连霍格沃兹的幽灵们也感到不安。更加令人担忧的是，霍格沃兹的保护魔法也开始失效，城堡的墙壁开始渗出一种黑色的液体，空气中弥漫着一股腐臭的味道。
哈利和他的朋友们终于在一卷古老的羊皮纸上找到了关键的线索。这段文字记载着一种古老的仪式，可以重新封印黑暗力量，但需要一件极为珍贵的魔法物品——时间沙漏。这个沙漏据说可以控制时间的流动，但早在几个世纪前就已经失踪了。
他们决定分头行动，寻找时间沙漏。赫敏和罗恩前往欧洲大陆，追寻那些古老魔法家族的传说，哈利则前往魔法部，希望能在档案室里找到一些线索。
在魔法部的档案室里，哈利遇到了旧日的同事小天狼星·布莱克。他们一起翻阅了大量的文件，终于在一份尘封已久的档案中找到了时间沙漏的踪迹。这个沙漏曾经被霍格沃兹的一位校长收藏，但在他去世后，沙漏便神秘消失了。
随着线索的不断增加，哈利发现时间沙漏可能被藏在霍格沃兹地下的密室中。然而，这个密室从未被人发现过，只有通过解开一系列复杂的谜题才能进入。
时间紧迫，黑暗力量的影响越来越大。哈利和他的朋友们必须在黑暗力量彻底苏醒之前找到时间沙漏，重新封印它。他们面对的是前所未有的挑战，但为了保护霍格沃兹和整个魔法界，他们决心无论付出多大代价，都要完成这个任务。
“哈利，我们必须找到那本失落的古籍，”麦格教授低声说道，“只有它才能揭示出关于时间沙漏的真正秘密。”
哈利点了点头，心中充满了紧张和焦虑。他知道时间紧迫，黑暗力量的威胁日益迫近。他们进入了藏书阁最深处，这里布满了尘封已久的书籍和卷轴，每一本书都承载着无数的秘密和历史。
“你真的认为我们能找到那本书吗？”哈利忍不住问道，声音中带着一丝疑虑。
“我们别无选择，”麦格教授坚定地回答，“每一个线索都指向这里。相信自己，哈利。”
他们开始仔细搜索藏书阁的书架，手指轻轻划过一本本古老的书籍。时间在无声中流逝，哈利的心跳声似乎越来越快。每一次翻开一本书，他都希望能够找到他们需要的答案，但却一次次失望。
“这里有太多的书了，”哈利喃喃道，眼中闪过一丝疲惫，“我们得加快速度。”
就在这时，麦格教授突然停下脚步，眼神凝视着一本特别古老的书籍。书的封面上覆盖着厚厚的灰尘，但隐约可以看到一些奇特的符文。她小心翼翼地将书拿下来，轻轻吹去灰尘，露出了书的标题：《时间的秘密》。
“哈利，我想我们找到了，”麦格教授低声说道，声音中带着一丝兴奋。
哈利急忙凑过来，眼中闪烁着希望的光芒。他们翻开书页，发现里面详细记载了时间沙漏的来历和使用方法。哈利的心情逐渐放松，但一种新的担忧却油然而生。
“我们必须尽快找到时间沙漏，然后执行书中描述的仪式，”哈利坚定地说，“这可能是我们唯一的机会。”
麦格教授点了点头，“但是，这个仪式需要强大的魔力和精准的时间控制，一旦失败，我们将面临更加严重的后果。”
“我们做到了，教授，”哈利喘着气说道，“霍格沃兹的结界重新强化了。”
麦格教授点了点头，眼中闪过一丝欣慰，“你做得非常好，哈利。现在，你需要好好休息，我们会继续研究这本书，找到更多对抗黑魔法的方法。”
哈利感到一阵轻松，虽然身体疲惫，但心中充满了成就感。他知道，这只是一个开始，未来还有更多的挑战等待着他和他的朋友们。
在接下来的几天里，哈利和他的朋友们继续研究《黑暗源起》，寻找更多对抗黑魔法的有效方法。每一页都充满了未知的危险，但他们没有退缩，一直坚持不懈。