北京紫禁城，新皇朱由检这段时间过得可谓是一会战战惶惶汗出如浆，一会战战兢兢汗不敢出。他的祖父万历皇帝不喜欢自己的父亲，一心想要立福王为太子。自己的母亲在宫里更是地位低下并且因为小错被父亲杖毙，小小的朱由检从此没有父爱也没有母爱。
他听闻帮助自己父亲稳固太子之位的东林党人发现他并不愿意按照东林党人的那一套来做，于是就有了一个月皇帝暴毙，然后就看到自己的皇兄如何抬举魏忠贤处处打压东林党人。然后自己的皇兄年仅二十三就暴毙了。
大明一朝对待亲王就像养猪一样的，朱由检没有受到过系统的皇储教育，也不知道自己如何才能让东林党人满意，同样也不知道魏忠贤会不会成为赵高那样的人。
所以进宫后他听从了嫂子的意见不吃宫里面安排的食物，饿了悄悄第拿出藏在袖子里的干粮啃几口。困了拿过来侍卫们的宝剑抱着睡觉。这样过了几天逐渐地将新王府的随从们带进宫里已保障自己的安全。
与皇帝朱由检小心翼翼、如履薄冰不同的是曾经权倾天下的九千岁魏忠贤也很小心，不过他是小心地试探着小皇帝，魏忠贤深刻地认识到他所有的权利都来自皇帝，所以他想要和以往一样风光就必须再次获得新皇的信任，可这又是何其困难的一件事情。不过为了自己的荣华富贵他还是决定努力尝试讨好新皇。
天启帝临死前叮嘱崇祯帝说，魏忠贤“恪谨忠贞，可计大事”。这话朱由检听到了，魏忠贤也听到了魏忠贤为此高兴了很久，但很快就发现小皇帝根本就没有当回事。
当时，魏忠贤以司礼秉笔太监提督东厂。魏忠贤的亲信田尔耕为锦衣卫提督，崔呈秀为兵部尚书。朝廷内外遍布魏忠贤的死党。
初登大宝的崇祯像天启帝一样，优待魏忠贤和客氏，但是魏忠贤始终无法猜透朱由检的心思，于是送一些美女给崇祯。崇祯不好色，对美色毫无兴趣。但怕引起魏忠贤的疑心，于是将送来的4名女子全部留下，仔细搜身，发现4名女子的裙带顶端，都系着一颗细小的药丸，宫中称为“迷魂香”，实际上是一种能自然挥发的春药。
魏忠贤一计不成，另生一计，就派一个小太监坐在宫中的复壁内，手中持“迷魂香”，使室中自然氤氲着一种奇异的幽香，以达到催情的效果。这一招，同样被崇祯识破。对此朱由检大发感叹：“皇考、皇兄皆为此误矣！”
眼看着日子一天天过去，魏忠贤干脆采用更露骨的试探方式。授意一些无耻的臣工们不停地上疏，为魏忠贤大唱颂歌。山东巡抚李精白就是心领神会的中坚之一。崇祯读这些奏疏的时候，总是“且阅且笑”。中二少年不明白为什么满朝文武有这么多不要脸的赤裸裸滴巴结一个阉人。
眼看着皇帝不为所动，于是魏忠贤向皇帝上了一道《久抱建祠之愧疏》，向皇帝请求停止为他建造生祠。崇祯的批复不温不火：“以后各处生祠，其欲举未行者，概行停止。”这种顺水推舟之举，抑止了朝野上下对魏忠贤的崇拜，又不致引起魏忠贤的恼怒。
另一方面崇祯还不断嘉奖魏忠贤、王休乾、崔启秀等人。自然这是在等候时机，暗暗设法削弱魏忠贤的影响力。
与此同时朝廷中的大臣们，都在寻思保全自己的良策，有投机的，有不动声色的，有冒死直谏的。不过出人意料的是最后倒魏，竟然首先是由魏忠贤的党羽发动的。十月十三日，御史杨维垣上疏弹劾崔呈秀，却美化“厂臣”魏忠贤——“呈秀毫无益于厂臣，而且若厂臣所累。盖厂臣公而呈秀私，厂臣不爱钱而呈秀贪，厂臣尚知为国为民，而呈秀惟知恃权纳贿。”崔呈秀在魏忠贤将门下号称“五虎”之一，是魏忠贤的得力干将。而且，由于是魏忠贤的亲信，崔呈秀的儿子崔铎虽然目不识丁，居然中了进士。
除去崔呈秀，等于断了魏忠贤一臂。朱由检当然不愿意错过送过来的刀子，于是下诏免除崔呈秀兵部尚书一职，令他回乡守制。这掀开了倒魏的大幕。
闻风而动的官员们弹劾魏忠贤的奏疏接二连三地出现。崇祯帝一直不动声色，任由臣工们攻击魏忠贤的浪潮一波胜过一波，中间还得面对魏忠贤的哭诉。
不过很快新皇帝就下定了决心，十月二十六日，海盐县贡生钱嘉征上疏疏，列举魏忠贤的十大罪状：一、并帝；二、蔑后；三、弄兵；四、无二祖列宗；五、克削藩封；六、无圣；七、滥爵；八、掩边政、；九、伤民财；十、亵名器。
于是，朱由检决定立即开始行动，他先召魏忠贤，命令太监当着魏忠贤的面宣读钱嘉征的奏疏。魏忠贤跟着天启皇帝干了不少坏事，如今换了新皇帝自己位高权重遭人弹劾是早就有心里准备的。
看着小皇帝嘴角若有若无的笑容，魏忠贤知道这次事情不妙，于是立即去找他的赌友——原信王府太监徐应元，讨教对策。
徐应元劝魏忠贤辞去爵位，也许可以保富贵。魏忠贤思来想去觉得也只有以退为进这一招了，或许这样还能赢得新皇帝的信任，只要信任还在就能东山再起，于是次日，魏忠贤请求引疾辞爵，朱由检早就等着这一天了，毫不犹豫大笔一挥，准了！
魏忠贤哭天抢地跪谢皇恩然后苦逼兮兮地回去准备离宫了，但朱由检并没有因为魏忠贤的这番举动而减少对于魏忠贤的猜忌，相反他总觉得这样处理魏忠贤自己很不爽，又听闻是自己信王府里的老人给魏忠贤出的主意，心中就更加不快，于是将徐应元召来斥责一番并再次将魏忠贤贬往中都凤阳祖陵司香。致此魏忠贤算是彻底倒台，因为守皇陵怕到死也不能离开半步。